Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ODC1P11926 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODC1P11926 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ODC1P11926 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ODC1P11926 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ODC1P11926 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ODC1P11926 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms