Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GLI3P10071 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GLI3P10071 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GLI3P10071 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GLI3P10071 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GLI3P10071 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GLI3P10071 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GLI3P10071 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms