Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C4BP0C0L5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C4BP0C0L5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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