Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C4AP0C0L4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C4AP0C0L4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms