Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
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