Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAVP06756 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAVP06756 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms