Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EFNA2O43921 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms