Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYNGR2O43760 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms