Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3KT08 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3KT08 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3KT08 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms