Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP17L13C9JLJ4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms