Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYSRT1A8MQ03 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYSRT1A8MQ03 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms