Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC169A6NNP5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms