Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PCNX2A6NKB5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms