Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HELTA6NFD8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms