Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 USP6-205ENST00000574788 8464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02150-201ENST00000513157 2120 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CAPN3-206ENST00000397163 3228 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NCEH1-205ENST00000538775 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01182-202ENST00000510907 2228 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CYFIP2-210ENST00000522463 3477 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PCDH15-210ENST00000395438 5806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NSUN7-201ENST00000316607 3546 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SESTD1-203ENST00000428443 10615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BUB1-212ENST00000535254 3576 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL008721.2-201ENST00000609475 3754 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AP004147.1-201ENST00000505153 6314 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC137056.1-202ENST00000575772 753 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 EXOC6-202ENST00000371543 2714 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 TARID-209ENST00000630119 4294 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 CERS6-AS1-201ENST00000425636 2890 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP2-2Q9BYT5 PIBF1-208ENST00000617689 2882 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms