Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SGCAQ16586 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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