Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SMCO1Q147U7 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
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