Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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TCOF1Q13428 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TCOF1Q13428 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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