Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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IFT88Q13099 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
IFT88Q13099 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
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