Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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