Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms