Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
RYR3Q15413 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 FAM186A-204ENST00000543111 8200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RUNX1T1-201ENST00000265814 7284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RYR3Q15413 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125 ms