Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.2 ms