Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ALCAMQ13740 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ALCAMQ13740 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms