Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC010894.1-201ENST00000313760 361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2P78314 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms