Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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TRAF7Q6Q0C0 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TRAF7Q6Q0C0 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TRAF7Q6Q0C0 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TRAF7Q6Q0C0 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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TRAF7Q6Q0C0 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TRAF7Q6Q0C0 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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