Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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