Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms