Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SMCO1Q147U7 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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