Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTCH1Q13635 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTCH1Q13635 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTCH1Q13635 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTCH1Q13635 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
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PTCH1Q13635 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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