Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 GAGE12E-201ENST00000381698 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC099344.1-201ENST00000433548 492 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC138627.1-203ENST00000641872 1680 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SCML1-203ENST00000380045 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL133464.1-201ENST00000635130 1705 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PSMC1P7-201ENST00000495689 1315 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 BEND2-202ENST00000380033 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RN7SKP254-201ENST00000410685 310 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RN7SL516P-201ENST00000496127 297 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 Metazoa_SRP.167-201ENST00000614947 260 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SLFN13-209ENST00000533791 4121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
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MKRN4PQ13434 C7orf31-202ENST00000409280 3357 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 GCNT3-209ENST00000560585 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PGAM1P3-201ENST00000420790 565 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 PPIL1P1-201ENST00000423936 499 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
MKRN4PQ13434 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
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