Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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