Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MIR8089-201ENST00000620165 82 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TRIM5-202ENST00000380034 2991 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 IARS-205ENST00000443024 4341 ntTSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC8.1□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC02203-204ENST00000628444 2323 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 THAP12P7-201ENST00000520248 2290 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms