Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
MCCD1P59942 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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