Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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