Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CDKN3Q16667 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CDKN3Q16667 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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