Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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