Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
TRAM2Q15035 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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