Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HTR4Q13639 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HTR4Q13639 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms