Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
IFT88Q13099 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.03□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms