Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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