Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TMIEQ8NEW7 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TMIEQ8NEW7 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms