Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BBS9Q3SYG4 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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