Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SMCO1Q147U7 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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