Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PPP4R2-207ENST00000495566 559 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL021918.1-201ENST00000603933 236 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2P1-201ENST00000449689 2749 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 KLRD1-201ENST00000336164 3258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MAP2-203ENST00000361559 2038 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
MKRN4PQ13434 GABRB3-225ENST00000638099 2752 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNA5SP23-201ENST00000391006 105 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC003071.2-201ENST00000423857 315 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC016152.1-201ENST00000548344 521 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC007136.1-201ENST00000589141 199 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 LNPEP-201ENST00000231368 12752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORA10B-201ENST00000384458 133 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 L1TD1-201ENST00000498273 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
MKRN4PQ13434 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.1 ms