Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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PTPRMP28827 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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