Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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GTF3C6Q969F1 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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GTF3C6Q969F1 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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GTF3C6Q969F1 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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GTF3C6Q969F1 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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