Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 DCP1B-205ENST00000540622 1547 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CCNB3-204ENST00000376042 4693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LMO7-205ENST00000377534 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 XRCC6P2-201ENST00000457831 1822 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 BSPH1-201ENST00000344839 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC073900.1-201ENST00000429766 776 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CD86-202ENST00000330540 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SAMD5Q5TGI4 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms