Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC011894.1-201ENST00000603255 456 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MIR6760-201ENST00000617342 68 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
ANKRD39Q53RE8 OR2G2-201ENST00000320065 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ACTG1P24-201ENST00000423783 877 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR1M1-201ENST00000429566 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RN7SL698P-201ENST00000480095 302 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 IGLV3-13-201ENST00000518475 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ACTR3C-205ENST00000539352 570 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL139300.2-201ENST00000556332 553 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC007907.1-201ENST00000557953 451 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF98-205ENST00000601553 566 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AC007378.1-201ENST00000609765 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CCL17-202ENST00000616880 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.176-201ENST00000619772 282 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
ANKRD39Q53RE8 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms