Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms